发育医学电子杂志 Vol. 9 63-70 DOI: 10.3969/j.issn.2095-5340.2021.01.012
发育基础
综述
单细胞转录组测序数据在肿瘤研究 领域的分析技术
贺赞 渠鸿竹 许媛媛 刘承灵 赵华
1. 解放军总医院第一医学中心 皮肤 科，北京 100853；2.中国科学院北京基因组研究所 基因组科学与信息重点实验室， 北京 100101
Analysis techniques of single cell transcriptome sequencing data in tumor research
He Zan, Qu Hongzhu, Xu Yuanyuan, et al
摘要
单细胞测序技术自首次被提出以来［1］ ，为生物 医学领域的研究带来了巨大的变革。传统高通量 测序捕获的是样本所有细胞的整体平均值，然而， 对于生物医学，尤其是肿瘤领域而言，有时决定命 运的却是数量较少的个别细胞。为了描述机体发 育或疾病进展过程中细胞类型的多样性，研究各类 细胞发挥的功能与机制，我们需要对单一细胞进行 各种组学的广泛测量。单细胞测序技术正是对单 个细胞的各组学进行高通量测序分析的技术，主要 包括单细胞基因组测序、转录组测序和表观遗传学 测序等。其中单细胞转录组测序（single cell RNA sequencing，scRNA-seq）的关注重点放在转录组水 平上，不仅能更加精确地测量细胞内的基因表达 水平，而且能检测到罕见非编码 RNA 和低丰度的 差异性基因 ［2］ 。目前，scRNA-seq 在肿瘤、生殖、 免疫性疾病、干细胞生物学、神经发育等生物医学 领域被广泛应用于科研。其中，在肿瘤研究领域，
scRNA-seq 能够在单个细胞水平上揭示肿瘤内部的 异质性、癌细胞的克隆和进化、癌症早期侵袭、癌细
胞突变率和突变类型，追踪癌细胞的转移和扩散、 解释耐药性和微环境等，极大促进了肿瘤领域的基
础研究和临床应用。
关键词:
单细胞测序技术')" href="#">单细胞测序技术
细胞类型注释
肿瘤肿瘤
收稿日期: 2019-10-27
发布日期: 2021-01-29
基金资助:
国家自然科学基金（81672698）
通讯作者:
赵华
E-mail: luckhua301@163.com
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2021, Vol. 9 
